8) LAB. DE BIOINFORMÁTICA E BIOTECNOLOGIA COMPUTACIONAl/BioteC:

Atende ao PPGCB com 30 computadores conectados em rede que estão em uma infraestrutura própria, voltadas genômica, com softwares de bioinformática para a análise de dados de sequenciamentos genômicas e proteômicos, usando bioinformática estrutural para desenho e descobrimento de novos fármacos, modelagem molecular (software MODELLER), docking (AutoDock Vina e Maestro), Dinâmica Molecular (software GROMACS), assim como inúmeros outros pequenos software de alinhamento proteico e DNA. Há 30 máquinas com softwares para Windows: Linguagens de Programação (Python, Blender, Free Pascal, Digital Works), Apresentação de imagens (GIMP), Ghostscript, MikTeX, Visualizador de cromatogramas de sequenciamento de DNA (BioEdit), Docking Rígido entre proteína-ligante e visualização de proteínas (MMV); Para Ubuntu: Python, GIMP, Umbrello, Banco de dados para manipulação de ESTs de Genomas Sequenciados (MySql), Eclipse, FreePascal, Linguagem de Programação para Bioinformática (Perl), Flex, Wine, Pacote estatístico (R Statistics), Pacotes para tratamento de dados de sequenciamento de DNA (Phred, Phrap), Docking Rígido via ambiente texto (Gramm e AutoDockVina), Modelagem Molecular por Homologia (Modeller), Visualizador de Estruturas 3D (PyMol), análises estruturais (CCP4/Procheck, RMSD e resarea).

Área de concentração: BIOL / Linha de pesquisa: LP4

Projetos de pesquisa: Abordagem computacional para identificação de fármacos para tratamento da doença de Alzheimer e outras doenças crônicas degenerativas mediadas por processo inflamatório; Bioinformática aplicada ao estudo estrutural de marcadores em câncer e suas interações com drogas para descobrimento de novos alvos terapêuticos.